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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00009 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  896 b   |  22 lines
  1. ******************
  2. * Amidation site *
  3. ******************
  4.  
  5. The precursor of  hormones  and other active  peptides  which are C-terminally
  6. amidated is always directly followed [1,2] by a glycine residue which provides
  7. the amide group, and  most often by at  least two  consecutive  basic residues
  8. (Arg or Lys) which generally function as an active peptide  precursor cleavage
  9. site.  Although all amino acids can be amidated,  neutral hydrophobic residues
  10. such as Val or Phe are good substrates, while  charged residues such as Asp or
  11. Arg  are much less reactive.  C-terminal  amidation has not  yet been shown to
  12. occur in unicellular organisms or in plants.
  13.  
  14. -Consensus pattern: x-G-[RK]-[RK]
  15.                     [x is the amidation site]
  16. -Last update: June 1988 / First entry.
  17.  
  18. [ 1] Kreil G.
  19.      Meth. Enzymol. 106:218-223(1984).
  20. [ 2] Bradbury A.F., Smyth D.G.
  21.      Biosci. Rep. 7:907-916(1987).
  22.